考試試題不同、課程設置不同、培養方式不同、讀博要求不同、導師制度不同
1．考試試題不同
目前專碩考試的趨勢是統一考英語二和經濟學聯考綜合：英語二較英語一考察的英語詞匯量更少、分析能力要求更低、難度相對小；經濟類聯考綜合考察數學知識簡單，基本為初高中內容，添加邏輯能力的考察，整體難度小于數三。、
2．培養方式不同
金融碩士 應用型碩士 2年 自費
金融學碩士 學術型碩士 一般3年 公費或自費或委培
3 ．課程設置不同
在課程設置上金融學碩士作為學歷教育，重點是基礎教育、素質教育和專業教育，偏重理論知識的掌握和學習；金融碩士作為職業教育，則更多偏重于實務，學習的目的是為了解決實際工作中的問題。例如，金融學碩士第一年會著重學習高級微觀、高級宏觀、中級金融理論、金融史；金融碩士則不要求，更側重于金融工具、計量經濟學、統計學、證券投資的學習。
4．導師制度不同
按照教育部指導規劃，專業碩士采取雙導師制度，即社會導師和校內導師雙導師。
5．讀博要求不同
專業碩士不能直博，即不能直接保送讀博，但仍可以考博；學術型碩士目前改革試點院校提供較少比例的直博名額，入學篩選后確定。
6．總結??金融專碩代表未來方向
2012年是金融專碩面向應屆生招生的第二年，尚無畢業生，部分應屆考生對專碩就業持消極態度。事實上，隨著2012年碩士招生的改革不斷推進，專碩已經開始于學碩并駕齊驅，后者注重研究型人才培養，前者注重應用培養，各有所長；從中央財經、人大10級會計專碩的就業趨勢來看，完全不遜于學碩。金融專業本身就具有實踐性強的特點，兩年的全日職專業碩士（學碩一般三年）的培養方式更能滿足就業的需要。長期以來社會上一直存在大學教育與社會實踐。
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