安徽中醫(yī)藥大學(xué)創(chuàng)建于1959年，其前身為1952年創(chuàng)立的安徽省中醫(yī)進修班（學(xué)校）。1959年，安徽省政府正式批準成立安徽中醫(yī)學(xué)院，郭沫若先生題寫校名。1970年，安徽中醫(yī)學(xué)院并入安徽醫(yī)學(xué)院。1975年，國家教育部批準恢復(fù)安徽中醫(yī)學(xué)院。2000年，安徽省醫(yī)藥學(xué)校并入安徽中醫(yī)學(xué)院。2011年，省政府批準在安徽中醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上組建成立安徽省中醫(yī)藥科學(xué)院。2013年，教育部同意安徽中醫(yī)學(xué)院更名為安徽中醫(yī)藥大學(xué)。

學(xué)校是國家中醫(yī)臨床研究基地、國家中藥現(xiàn)代化科技產(chǎn)業(yè)（安徽）基地、國家中醫(yī)藥國際合作基地、國家藥品臨床研究基地、碩士研究生推薦免試單位。2005年以良好成績通過國家教育部本科教學(xué)工作水評估，2009年學(xué)校以優(yōu)異成績通過國家教育部中醫(yī)學(xué)專業(yè)試點認證。少荃湖新校區(qū)建設(shè)被列入安徽省“861”計劃，2013年上半年一期工程竣工并投入使用。

學(xué)校現(xiàn)占地總面積1171畝，有梅山路、史河路、少荃湖三個校區(qū)。東校區(qū)坐落于合肥市梅山路103號，西校區(qū)坐落于合肥市史河路45號，少荃湖校區(qū)坐落于前江路。教學(xué)科研儀器設(shè)備總值13872萬元。圖書館藏書175萬冊（其中紙質(zhì)圖書94.32萬冊），古籍部珍藏古籍線裝書3.3萬冊，是“全國古籍重點保護單位”。中藥標本中心儲藏了11萬份藥用植物臘葉標本，是全國醫(yī)藥院校珍藏標本最豐富的標本館。新安醫(yī)學(xué)文化中心是安徽省中醫(yī)藥文化宣傳教育基地。

學(xué)校現(xiàn)有全日制在校生13205人（其中博士生、碩士生1059人）。現(xiàn)有13個二級學(xué)院（部）、3所直屬附屬醫(yī)院、4所非直屬附屬醫(yī)院。現(xiàn)有教職工2500多人（含兩所附院），其中副高以上職稱人員500余人。國醫(yī)大師1人，安徽省高校領(lǐng)軍人才5人，博士生導(dǎo)師22人，碩士生導(dǎo)師333人；享受國務(wù)院特殊津貼23人、省政府特殊津貼8人；安徽省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人、后備人才25人；國家名老中醫(yī)學(xué)術(shù)經(jīng)驗項目指導(dǎo)老師26人。有來自國內(nèi)外的56名知名專家學(xué)者擔(dān)任我校客座教授。

學(xué)校現(xiàn)有23個本科專業(yè)（其中國家教育部高等學(xué)校專業(yè)5個，19個專業(yè)列入一本招生），有2個一級學(xué)科博士學(xué)位授予點，4個一級學(xué)科碩士學(xué)位授予點、25個二級學(xué)科碩士學(xué)位授予點、4個碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點。有安徽省學(xué)科建設(shè)重大項目2個、國家中醫(yī)藥管理局重點學(xué)科17個，省級B類重點學(xué)科11個，7個衛(wèi)生部國家臨床重點專科，21個國家中醫(yī)藥管理局重點建設(shè)專科、23個安徽省中醫(yī)藥重點專科。

學(xué)校以人才培養(yǎng)為第一要務(wù)，牢固確立教學(xué)中心地位，把提高教育教學(xué)質(zhì)量作為永恒主題，注重學(xué)生創(chuàng)新精神與能力素質(zhì)的培養(yǎng)，堅持“弘揚新安醫(yī)學(xué)，培育中醫(yī)人才”的辦學(xué)，人才培養(yǎng)質(zhì)量不斷提高。學(xué)校現(xiàn)有2個國家級教學(xué)團隊、8個省級教學(xué)團隊，1門國家級精品課程、35門省級精品課程。有1個國家級精品資源共享課程，1個國家級實驗實訓(xùn)示范中心，1個國家級專業(yè)綜合改革試點項目。5年來，先后獲國家級、省級質(zhì)量工程項目200余項，國家級教學(xué)成果獎1項、省級教學(xué)成果特等獎2項、一等獎2項。

學(xué)校注重辦學(xué)的彰顯，深入推進教學(xué)改革，舉辦新安醫(yī)學(xué)教改實驗班，在臨床專業(yè)建立客觀化結(jié)構(gòu)考試中心。2010年開始與長春、福建2所中醫(yī)藥大學(xué)開展相互交流培養(yǎng)學(xué)生；設(shè)立大學(xué)生課外科技創(chuàng)新與創(chuàng)業(yè)基金；開展“百人獲獎、千人參與、萬人受益”的大學(xué)生知識技能競賽和“挑戰(zhàn)杯”等各級各類競賽活動；廣泛開展各類社會實踐活動。2010?2015年學(xué)校共有學(xué)生200余人次在學(xué)術(shù)科技與創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)領(lǐng)域獲省部級以上表彰和獎勵80余項。學(xué)校曾被授予全國大中學(xué)生志愿者“三下鄉(xiāng)”社會實踐活動先進集體。2010年以來，學(xué)校畢業(yè)生均就業(yè)率在94%以上，連續(xù)獲得安徽省普通高校就業(yè)工作“先進集體”或“標兵單位”稱號。

學(xué)校大力推進科技強校戰(zhàn)略，積極促進教學(xué)水與人才培養(yǎng)質(zhì)量的提高。5年來，學(xué)校共承擔(dān)各級各類項目1300余項，其中承擔(dān)國家“973”計劃、國家“863”計劃、國家科技支撐計劃、星火計劃重點項目、重大新藥創(chuàng)制專項、國家自然科學(xué)基金和社會科學(xué)基金等國家級項目196項，科研經(jīng)費2億余元；取得研究成果300余項，獲得省部級以上科技獎勵42項（其中國家科技進步二等獎1項,中華中醫(yī)藥學(xué)會科技獎一等獎1項）。現(xiàn)有10個省級科技創(chuàng)新團隊，28個省級以上重點實驗室及工程（技術(shù)）研究中心。建立了安徽省中藥材科技產(chǎn)業(yè)戰(zhàn)略聯(lián)盟。學(xué)校被國家科學(xué)技術(shù)部授予“全國科技特派員工作先進集體”稱號，被國家中醫(yī)藥管理局授予“中醫(yī)藥科技管理工作先進集體”稱號。學(xué)校獲中華中醫(yī)藥學(xué)會“推動中醫(yī)藥學(xué)術(shù)發(fā)展特別貢獻獎”。

學(xué)校不斷加強產(chǎn)學(xué)研用合作，服務(wù)地方經(jīng)濟社會建設(shè)能力不斷增強。建校以來，我校培養(yǎng)了4萬余名高素質(zhì)的中醫(yī)藥人才，遍布安徽省及國內(nèi)外醫(yī)藥領(lǐng)域。學(xué)校與黃山、亳州、績溪、舒城等市縣人民政府簽訂全面合作協(xié)議，與河南宛西、江蘇康緣、深圳三九等國內(nèi)知名中醫(yī)藥企業(yè)簽訂戰(zhàn)略合作協(xié)議，建有亳州濟人藥業(yè)等30個產(chǎn)學(xué)研合作基地，服務(wù)地方經(jīng)濟社會發(fā)展的能力不斷提升。積極為政府在出臺有關(guān)中醫(yī)藥發(fā)展規(guī)劃和相關(guān)政策提供決策咨詢，學(xué)校在國家中藥現(xiàn)代化科技產(chǎn)業(yè)（安徽）基地建設(shè)中做出了積極貢獻。第一附屬醫(yī)院是全省最大的三級甲等綜合性中醫(yī)醫(yī)院；第二附屬醫(yī)院是全國首家也是規(guī)模最大的三級甲等針灸專科醫(yī)院；第三附屬醫(yī)院是國家第三批重點建設(shè)的中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院，神經(jīng)病學(xué)研究所附屬醫(yī)院是一所國內(nèi)外有影響的以“肝豆狀核變性診治”為優(yōu)勢的專科醫(yī)院，國醫(yī)堂是一所為廣大患者以純中醫(yī)方式為主要醫(yī)療手段的醫(yī)療單位，其都成為開展社會服務(wù)的重要力量。

學(xué)校與美國、澳大利亞等19個國家和地區(qū)的50個醫(yī)療和教育機構(gòu)建立了友好合作關(guān)系。1994年獲準招收國外留學(xué)生，先后有20多個國家和地區(qū)的學(xué)員來校攻讀碩士、學(xué)士學(xué)位以及臨床研修。與美國、瑞典、新加坡、日本、韓國及港澳臺地區(qū)的院校開展學(xué)者互訪和學(xué)生交流活動。

在57年的辦學(xué)歷程中，學(xué)校逐漸形成了以“至精至誠、惟是惟新”為校訓(xùn)的優(yōu)良傳統(tǒng)。目前，學(xué)校已發(fā)展成一所以中醫(yī)藥學(xué)科為主，相關(guān)學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，辦學(xué)層次齊全，中醫(yī)藥鮮明的高等中醫(yī)藥院校。

面向未來，學(xué)校將以鄧小理論、“三個代表”重要和科學(xué)發(fā)展觀，堅定中醫(yī)信念，弘揚中醫(yī)精神，秉承“至精至誠、惟是惟新”的理念，實施“質(zhì)量立校、人才興校、科技強校、弘校、文化塑校、和諧融校”的辦學(xué)方略，圍繞，強化優(yōu)勢，提升質(zhì)量，著力培育“精誠是新”中醫(yī)藥人才，構(gòu)筑安徽中醫(yī)藥協(xié)同創(chuàng)新高地，弘揚“北華佗南新安”中醫(yī)藥文化，引領(lǐng)安徽中醫(yī)藥事業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展，建成富有、卓有貢獻、高水有影響的安徽中醫(yī)藥大學(xué)，為建設(shè)美好安徽、服務(wù)人民大眾健康做出更大貢獻。